迷失岛神庙中有很多的密室和需要解密打开的暗格，有的箱子的密码需要玩家非常的仔细，或者说一个游戏初期就能看到的箱子在游戏后期才能打开。
首先在最开始的灯塔之下，我们可以找到二周目能拿到的第一个道具，一个印有图案的三角形石头。进入到灯塔之后，根据一周目的额方法解密来到二楼上，点击左边墙上的纸张。发现与一周目我们看到的东西不一样，一周目告诉你怎么打开一楼的门，现在则是告诉你本周目最重要的密室的打开方法，因为一周目的时候你已经知道怎么打开大门了。跟着一周目的线路走拿到其他的一些道具，最后来到工厂里面。我们可以发现工厂的左下角的地上多摆放了一个铁箱子，这是我们一周目的时候没有的。点击之后可以看到八个三角形围成花的图案，正中间是一个黑色的眼睛，但是我们现在打不开它。继续向工厂里面走，在一周目章鱼怪那可以找到灯塔纸上第二个三角形。来到神庙门口，在地图左边的山壁上数字五的旁边能找到第三块三角形。在神庙的门口我们向左走来到飞行器的二楼，在二楼的密码箱里可以找到第四块三角形。进入神庙来到神庙二楼，可以看到雕塑旁边有一个紧闭的大门，这是二周目最关键的密室的位置所在。但是打开增们需要我们找齐六个三角形，截止至当前，我们已经中找到了四个。再次跟着一周目我们的做法走，点亮灯塔，进入船里面可以在左下角的桌子上发现第五块三角形。然后继续进行一周目的探索，来到金字塔的楼梯前，可以看到右边墙上有一只虫子在爬，把他打死，顺便把墙打烂可以在墙上发现一个刻有图案的石板。金字塔继续往里走，解开一个华容道的解密后来到石像旁边，石碑钱就是最后一块也是第六块三角形石头。
回到雕塑门口的密室，将手里的六块石头按照灯塔纸张的提示放入，最关键的密室就这样打开了，进入密室后可以看到墙上的密码锁。这时候回到工厂找到最开始的铁盒子，将红眼放进去并点亮他的眼睛拿到盒子里的铁锥。回到密室中根据墙里石板提示连接电路，会给你一张纸。回到有着章鱼雕像的密室里点击头顶的钢管就可以完后即可达成真结局。
